まいける様はEAつくーるをご利用いただいている方ですね。
いつもありがとうございます。
EAつくーるでご作成いただく場合について、回答させていただきます。

> MT5の取引業者の制限は不可能なのでしょうか？

可能でございます。
「取引業者制限」オプションのチェックを付けていただき、許可する業者名をご入力ください。

> また制作したEAのソースコードをみれないようにするにはなにかコードをつけたさなくてはいけないのでしょうか？
.ex4、.ex5のファイルはみれないような仕様で合っていますか？

基本的に、.ex4、.ex5にコンパイル（変換）すれば、普通の方法ではソースコードが見られなくなります。
特にコードを付け足していただく必要はございません。

厳密には、専用のツールを使用して「デコンパイル」という操作をすれば見られてしまいますが、この行為を防ぐのは難しいです。
ご不安な場合は、コードの難読化によりロジックをわかりにくくするとよいでしょう。
少しプログラミングの知識が必要になります。「mql5 デコンパイル対策」といったワードで検索すると、詳しい情報が見つかると存じます。