建値ストップを「ポジション3・4だけ」に効かせたい、というご質問ですね。

結論からお伝えすると、現在のEAつくーるの仕様上、
「建値ストップ」オプションを特定のポジション（例：ポジション3・4）だけに限定して適用することはできません。
建値ストップを有効にすると、同じEAが持っている全ポジション（全マジックナンバー）が対象になります。

そのため、ナンピン用のポジション1・2にも建値が入ってしまう挙動は、仕様通りの動きになります。

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なぜポジション1・2にも建値が入ってしまうのか

ご質問の設定は次のようなイメージだと思います。

• ポジション1：ロング（ナンピンあり）
• ポジション2：ショート（ナンピンあり）
• ポジション3：ロング（追加ポジション、カスタムロット＆SL設定）
• ポジション4：ショート（追加ポジション、カスタムロット＆SL設定）
• 「オプション」画面で「建値ストップ」にチェックを入れている

EAつくーるの「オプション」で設定する建値ストップは、

• 「このEAが持っているポジション全体」を見て処理する
  （ポジション1〜4をまとめて対象にする）

という作りになっており、

• ポジション3・4のために建値ストップをONにしても
• 同じEAが持っているポジション1・2（ナンピン中）も判定対象になり、
  一定の利益が出たタイミングでSLが建値に移動してしまう

という挙動になります。

「ポジションごとに建値ストップのON/OFFを切り替える項目」は、現状の設定画面には用意されていません。

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EAつくーるだけでできる回避策

EAつくーるの機能だけでできる現実的な回避策としては、
「EAを役割ごとに分割する」方法がいちばんシンプルです。

1. EAを2つに分ける

1つ目のEA（ナンピン専用）

• ポジション1：ロング（ナンピン）

• ポジション2：ショート（ナンピン）

• 「オプション」では「建値ストップ」を使わない

• ナンピンオプションのみ使用

  • 基本項目の「損切り」「利食い」は0にしておく（ナンピン仕様に合わせる）

2つ目のEA（追加ポジション＋建値専用）

• ポジション1：ロング（※ここで、元のポジション3のロジックを再現）

• ポジション2：ショート（※ここで、元のポジション4のロジックを再現）

• 必要に応じてナンピンは使わず、カスタムロットとSLを設定

• 「オプション」で「建値ストップ」にチェックを入れる

  • 間隔（例：20pips）
  • 補正値（必要に応じて0〜数pips）

この2つのEAを、同じ通貨ペア・同じ時間足のチャートにそれぞれ適用します。

EAつくーるでは、

• EA内の「ポジション番号」と「マジックナンバー」が1対1で対応しています

  • ポジション1 → マジック1
  • ポジション2 → マジック2

という形になるため、EAを分けることで、

• EA A（ナンピン用）：マジック1・2、建値ストップなし
• EA B（建値用）：マジック1・2、建値ストップあり

というように役割を分けて運用できます。
（EAごとにマジックナンバーが独立しているため、互いに干渉しません。）

※「同じチャートに複数EAを載せると不安」という場合は、
　同一通貨ペアで時間足を分ける（例：ナンピンEAはM15、建値EAはM5）という運用も一案ですが、
　その場合はロジックの前提が変わってしまう点に注意が必要です。

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MQLでの補足（カスタム編集）について

もしどうしても「1つのEAの中で、ポジション3・4にだけ建値ストップをかけたい」という場合は、
EAつくーるで生成されたmq4/mq5ファイルをMetaEditorで開き、
建値ストップの処理部分をマジックナンバーで絞り込む必要があります。

イメージとしては、EAのコードの中で

• 注文やポジションをループしている「建値ストップ」用のブロックを探す

  • コメントで「// 建値ストップ」などと書かれている部分にまとまっていることが多いです

• そのループの中で
  「マジックナンバーが3または4のポジションだけ処理する」
  という条件を追加する

という形です。

MT4のイメージ（概念図・擬似コード）：

for (int i = OrdersTotal() - 1; i >= 0; i--) {
    if (!OrderSelect(i, SELECT_BY_POS, MODE_TRADES)) continue;

    // ここでポジション番号ごとのマジックを判定
    int magic = OrderMagicNumber();

    // ポジション3・4だけ建値ストップを適用する
    if (magic != 3 && magic != 4) {
        continue; // 1・2のポジションはスキップ
    }

    // ここに、EAつくーるが自動生成した建値ストップの処理が入る
}

MT5でも考え方は同じで、「PositionGetInteger(POSITION_MAGIC)」などでマジックを取得して
3と4だけを対象に建値処理を行う形になります。

ただし、

• EAつくーるのコード構造にある程度慣れている必要がある
• 一度手作業でコードを編集すると、そのEAはEAつくーるの画面から再出力して上書きできない（再出力すると編集内容が消える）

といった点があるため、初心者〜中級者の方には、

• まずは「EAを役割ごとに分ける」運用（前述の2EA方式）

をおすすめします。

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まとめ

• 建値ストップはEAつくーるの「オプション」で一括設定する仕様のため、
  「ポジション3・4だけ建値ストップを適用し、ポジション1・2（ナンピン）には適用しない」という制御は、
  EAつくーるの設定画面だけでは行えません。

• EAつくーるだけで対応する場合は

  • ナンピン用EA（建値ストップなし）
  • 建値ストップ用EA（追加ポジションのみ）
    の2つにロジックを分けて運用する方法が現実的です。

• 1つのEA内でどうしても実現したい場合は、
  生成されたmq4/mq5をMetaEditorで開き、建値ストップ処理に
  「マジックナンバー3・4のみ対象」という条件を追加する必要があります。