ATRの閾値を通貨ペア共通にしたいので、pipsではなく「価格に対する割合（％）」でATRを判定したい、というご質問ですね。

残念ながら、EAつくーるの画面設定だけで「ATRを％換算して比較する」指定はできません（取引条件の左辺・右辺は1項目ずつで、四則演算を組み合わせられないため）。
そのため、ご要望どおりにやる方法は **「出力したEA（MQL）の条件式を少しだけ修正する」**形になります。

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設定方法（コード修正を提案）

1) 考え方（ATR% の定義）

「n本前のATRを％換算」したものを ATR%[n] とすると、以下です。

• ATR%[n] = ATR[n] / close[n] * 100

ここで close[n] は「n本前の終値」です。
（例：計算位置が0本前なら close[0]、1本前なら close[1]）

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2) EAつくーる側で“元になる条件”を作る

取引条件画面で、まずは通常どおり ATR同士／ATRと数値 の比較を作っておきます。
その後、出力されたMQL内の条件式を、下記のように“割り算を足す”形で差し替えます。

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例1：ATR％ と 固定値（％）を比較したい場合

やりたい条件がこれだとして：

• ATR%[n] < 30

EAつくーるで作る条件（まずは形だけ）

取引条件で、いったん次を作成します（nは任意）：

ATR（計算期間:10, 計算位置:n本前） < 数値（値:30）
↓
（エントリー／決済の任意のアクション）

出力後のコードを修正（左辺をATR%に変更）

生成されたEA（mq4/mq5）をMetaEditorで開き、上の条件に相当する比較部分を探して、左辺に「/ close[n] * 100」を追記します。

ATR[n] / close[n] * 100 < 30

• このときの close[n] は「n本前のローソク足の終値」のコードを、そのままコピペして使ってください（MT4/MT5で書き方が違うため、EA内で終値を取得している箇所の記述を流用するのが確実です）。

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例2：ATR％ 同士を比較したい場合

やりたい条件がこれだとして：

• ATR%[m] < ATR%[n]

EAつくーるで作る条件（まずは形だけ）

取引条件で、いったん次を作成します（m,nは任意）：

ATR（計算期間:10, 計算位置:m本前） < ATR（計算期間:10, 計算位置:n本前）
↓
（エントリー／決済の任意のアクション）

出力後のコードを修正（両辺をATR%相当に変更）

比較の両辺に「/ close[ ]」を付けます。

ATR[m]/close[m] < ATR[n]/close[n]

• 本来は両辺に *100 もありますが、左右で打ち消し合うので付けなくてOKです。

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こうなっていませんか？（よくある修正ミス）

• 計算位置（n本前）と close[n] がズレている
  例：ATRは1本前を見ているのに close[0] を割ってしまう、など。
  → ATRの計算位置と同じ[n] を close 側にも使ってください。

• close の取得を“現在の価格（Bid/Ask）”で割ってしまう
  → 検証条件の再現性を高めるなら、原則 ローソク足の終値 close[n] で揃えるのが安全です。

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ご参考になれば幸いです。
引き続きよろしくお願いいたします。